11 trong số 14 ngân hàng thương mại cổ phần của thành phố đã thông qua phương án tổ chức lại. Tuy nhiên, theo Ngân hàng Quốc gia TP.HCM, một trong những khó khăn trong quá trình tái cơ cấu hệ thống ngân hàng hiện nay là do tình trạng này khó tìm được nhà đầu tư đủ năng lực tài chính và quản trị. Tình hình kinh tế vĩ mô trong và ngoài nước không tốt. . Sở hữu chéo cũng là nguyên nhân chính khiến ngân hàng chậm tiến độ tái cơ cấu.

Ngoài ra, tiêu chuẩn bảo mật của các tổ chức tín dụng chưa đáp ứng được tiêu chuẩn quốc tế, năng lực quản lý chính sách còn hạn chế nên chưa thu hút được các nhà đầu tư nước ngoài.

Nợ xấu, sở hữu chéo … là nguyên nhân khiến quá trình tái cơ cấu của các ngân hàng trên địa bàn TP.HCM bị đình trệ, nguồn lực tài chính công hỗ trợ xử lý nợ xấu cũng ảnh hưởng đến quá trình tái cơ cấu của các tổ chức tín dụng. Tính đến ngày 28/2, tổng nợ xấu trên địa bàn TP.HCM đã vượt 45,8 nghìn tỷ đồng. Các chi nhánh của Ngân hàng Quốc gia đã phân bổ các đơn vị kinh doanh, tổ chức cho vay, bao gồm cả khách hàng của tổ chức cho vay, phát triển các giải pháp và lộ trình để quản lý toàn diện các khoản nợ xấu mà không loại bỏ chúng. Ngân hàng Quốc dân chi nhánh TP HCM cho biết, tính đến ngày 28/2, tổng tài sản của 14 ngân hàng có trụ sở chính tại TP HCM đạt 119,2083 tỷ đồng, giảm 0,6% so với cuối năm 2013. Tuy nhiên, cơ quan quản lý cho biết, cơ cấu và chất lượng tài sản ngân hàng được kiểm soát theo hướng an toàn và phát triển bền vững. Tổng vốn điều lệ của -14 ngân hàng đạt 86,7 nghìn tỷ đồng, bằng cuối năm 2013, trong đó vốn đăng ký cao nhất của Saigon Tongtian Bank là 124,2 tỷ đồng.